תיקון כרת בא על עבירות שעונשן כרת ומובאות במשנה במסכת כריתות- "שלושים ושש כריתות בתורה" (פרק א', משנה א') וביניהן: "משכב זכור, הבא על אשת איש, על הנידה,העובד עבודה זרה, המחלל את השבת, האוכל חמץ בפסח, האוכל והעושה מלאכה ביום הכיפורים ועוד ועוד…". יש המפרשים כי עונש כרת הינו מיתה בידי שמים או מיתה בקיצור ימים ושנים, לדעת הרמב"ם ע"ה עונש כרת הוא לעולם הבא וכך הוא כותב בהלכות תשובה: "טובה הצפונה לצדיקים, היא חיי העולם הבא….
הנקמה שאין נקמה גדולה ממנה – שתיכרת הנפש ולא תזכה לאותן החיים, שנאמר "היכרת תיכרת הנפש ההיא, עוונה בה" (במדבר טו,לא). וזה האובדן הוא שקוראין אותו הנביאים דרך משל "באר שחת" ו"אבדון" ו"תופתה" ו"עלוקה"; וכל לשון כליה והשחתה קוראין לו, לפי שהיא הכליה שאין אחריה תקומה לעולם וההפסד שאינו חוזר לעולם".
תיקון כרת מבוצע על ידי תלמיד חכם יר"ש, והוא לימוד של לילה שלם (ללא שינה) עד עמוד השחר, בתענית חלקית (שתיית מים וקפה בלבד) וכולל לימוד של 40 פרקי משניות (מסכת חולין, יומא, ידים ומקוואות = ראשי תיבות "חיים" בנוסף למסכת כריתות), לימוד של הזוהר הקדוש, תיקון היסוד ואמירת "קדיש על ישראל", בתפילת שחרית.